Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ric1Q69ZJ7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ric1Q69ZJ7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ric1Q69ZJ7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ric1Q69ZJ7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ric1Q69ZJ7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ric1Q69ZJ7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ric1Q69ZJ7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ric1Q69ZJ7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ric1Q69ZJ7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ric1Q69ZJ7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms