Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Knl1Q66JQ7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Knl1Q66JQ7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms