Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt12Q64291 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms