Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ift52Q62559 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms