Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CochQ62507 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CochQ62507 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CochQ62507 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CochQ62507 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CochQ62507 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CochQ62507 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CochQ62507 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms