Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssr4Q62186 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssr4Q62186 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms