Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Npm1Q61937 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Npm1Q61937 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms