Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Foxd1Q61345 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Foxd1Q61345 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Foxd1Q61345 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Foxd1Q61345 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Foxd1Q61345 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Foxd1Q61345 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Foxd1Q61345 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Foxd1Q61345 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms