Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gbp4Q61107 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp4Q61107 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms