Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp17laQ61068 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp17laQ61068 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp17laQ61068 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp17laQ61068 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp17laQ61068 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp17laQ61068 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp17laQ61068 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp17laQ61068 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp17laQ61068 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp17laQ61068 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp17laQ61068 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp17laQ61068 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp17laQ61068 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp17laQ61068 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms