Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Klf3Q60980 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Klf3Q60980 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms