Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp7Q60973 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms