Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Atf3Q60765 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf3Q60765 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms