Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sin3aQ60520 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms