Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim38Q5SZ99 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trim38Q5SZ99 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim38Q5SZ99 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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