Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms