Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms