Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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