Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srbd1Q497V5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srbd1Q497V5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms