Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lin28bQ45KJ6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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