Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms