Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rbm44Q3V089 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms