Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms