Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TceancQ3US16 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms