Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zscan4fQ3URS2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zscan4fQ3URS2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms