Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms