Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cog7Q3UM29 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms