Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms