Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rmdn3Q3UJU9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms