Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pitpnm3Q3UHE1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pitpnm3Q3UHE1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms