Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms