Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trafd1Q3UDK1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms