Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cops9Q3U898 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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