Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms