Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TchpQ3TVW5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TchpQ3TVW5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TchpQ3TVW5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TchpQ3TVW5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TchpQ3TVW5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TchpQ3TVW5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TchpQ3TVW5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TchpQ3TVW5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TchpQ3TVW5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TchpQ3TVW5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms