Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fndc4Q3TR08 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fndc4Q3TR08 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc4Q3TR08 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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