Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms