Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam178bQ24JP3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms