Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd300lgQ1ERP8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms