Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lrriq3Q14DL3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lrriq3Q14DL3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrriq3Q14DL3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Lrriq3Q14DL3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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