Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b1Q148W0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b1Q148W0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms