Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gli2Q0VGT2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli2Q0VGT2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms