Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2b3Q0VF55 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms