Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rundc1Q0VDN7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rundc1Q0VDN7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms