Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cib3Q0P523 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib3Q0P523 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms