Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrioQ0KL02 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms