Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssrp1Q08943 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ssrp1Q08943 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms