Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Nfe2Q07279 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Nfe2Q07279 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Nfe2Q07279 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Nfe2Q07279 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Nfe2Q07279 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Nfe2Q07279 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Nfe2Q07279 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Nfe2Q07279 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nfe2Q07279 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Nfe2Q07279 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Nfe2Q07279 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Nfe2Q07279 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfe2Q07279 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms