Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah1bQ06985 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms