Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr16c6Q05A13 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms